CeGaT je uspostavio i potvrdio opsežne panele tekuće biopsije za procjenu slobodne DNK koja cirkulira u krvotoku (cfDNK). Budući da samo dio cfDNK potječe iz tumora (ctDNK ili cirkulirajuća tumorska DNK) sadržaj ctDNK može varirati. Za analizu potreban je sadržaj tumora od najmanje 20%. Međutim sadržaj ctDNK može biti manji od 20%, te smo zbog toga razvili visoko osjetljivu analizu nazvanu CancerDetect® s nižim pragom detekcije (dovoljno je 1% tumorskog DNK). CancerDetect® se fokusiramo na otkrivanje terapijski relevantnih i najčešće mutiranih žarišnih točaka u genomu tumora, kao i odabranih genskih fuzija.
Bilo da se radi o molekularno-genetskoj dijagnozi kao pojedinačnom nalazu, serijskoj analizi za praćenje ranog otkrivanja recidiva ili tijeku terapije, CancerDetect® može adekvatno odgovoriti na svako zadano pitanje. CancerDetect® identificira varijante sekvenci u najčešćim mutacijama s učestalošću alela iznad 0,25% (NAF). Visoka osjetljivost metode čini neuspjeh mnogo manje vjerojatnim, čak i uz nisku frakciju tumora u uzorku (sadržaj ctDNK do 1%).
CancerDetect® test koristeći tehnologiju temeljenu na dupleksnom UMI-ju, koja detektira varijante sekvenci u aktivnim, najzastupljenijim žarišnim točkama. Osim toga, uzorkovanje je neinvazivno i lako ponovljivo, što CancerDetect® čini izvrsnim pristupom za praćenje terapije. Vrlo osjetljivom detekcijom biomarkera specifičnih za tumor (ctDNK) može se koristiti kao marker za odgovor na liječenje tijekom medicinskog praćenja.
Za mnoge somatske analize temeljene na tekućoj biopsiji, korisno je promatrati promjene u rezultatima tijekom vremena i tumačiti ih u kliničkom kontekstu. S novim izgledom izvješća o praćenju, podaci iz serijskih CancerDetect® analiza sažeti su u jednom izvješću i mogu se protumačiti na prvi pogled. Rezultati svakog dodatnog uzorka integrirani su u postojeća izvješća. Ažurirani grafikon progresije i odgovarajuće tablice jasno pokazuju trend praćenih promjena na temelju učestalosti varijante. Mogu se izvući zaključci o tijeku bolesti, te na vrijeme prepoznati uspješnost terapije i pojava rezistentnih mutacija (Slika 1).
Slika 1.
Što CancerDetect® čini posebnim
- Vrlo osjetljivom detekcijom ctDNK može se koristiti za praćenje dinamike tumora u stvarnom vremenu i intervenirati ili prilagoditi liječenje ako je potrebno (npr. kod stečene rezistencije na lijekove). Ako analiza ctDNK pokazuje smanjenje broja tumorskih mutacija ili njihov nestanak, to može ukazivati na to da je terapija uspješna. Međutim, ako se pojave nove mutacije ili se razina ctDNK poveća, moguće je razmotriti promjenu terapije.
- U slučaju serijskog uzorkovanja, rezultati prethodnih analiza automatski se uzimaju u obzir, a napredak je jasno prikazan kao na slici 1. Ovdje je fokus na mogućim promjenama u najčešćim varijantama važnih mutacija tijekom vremena.
- Sustav praćenja ima fleksibilnu strukturu i razmatra promjenu učestalosti svake somatske varijante zasebno. Stoga je u bilo kojem trenutku moguće integrirati novonastale promjene u izvješće o napredovanju.
- Sve bitne nalaze izvijestit ćemo u liječničkom nalazu. To uključuje popis svih identificiranih klinički relevantnih varijanti. Izvješće sadrži popis svih identificiranih klinički relevantnih varijanti i terapijskih opcija izvedenih iz njih za svaki prvi uzorak serije, kao i za pojedinačne analize sa samo jednim ispitivanjem uzorka. Za svaki gen detaljno je prikazana somatska promjena i navedene su terapijske mogućnosti, uključujući odobrenje EMA/FDA.
- Na kraju medicinskog izvješća, u prilogu/suplementu, dajemo opširan popis mogućih terapijskih strategija za svaku identificiranu somatsku promjenu. Ovaj popis uključuje klase i nazive lijekova kao i njihovo odobrenje (FDA/EMA) i ograničavajuće uvjete. Pregled terapijskih opcija prikazan je u cijelosti u svakom prvom izvješću serijske kontrolne dijagnoze.
- Svako pojedinačno medicinsko izvješće priprema i razmatra interdisciplinarni tim znanstvenika i liječnika kako bi se zajamčila najviša kvaliteta.
CancerDetect® je idealan za nadgledanje i praćenje
Temeljita analiza
Vrlo osjetljiva i točna detekcija najvažnijih i najčešćih mutacija u 31 genu i fuzija gena u 6 gena s vrlo niskim frekvencijama alela korištenjem duplex UMI tehnologije (NAF ≥ 0,25%). Stoga detektira čak i najmanje količine ctDNK koje su relevantne za širok raspon tumorskih entiteta.
Visoka pokrivenost
Visoka pokrivenost od 50 000–100 000x omogućava detekciju varijanti relevantnih za terapiju čak i s niskim sadržajem tumora u uzorku (1%)
Jednostavno uzorkovanje
Neinvazivno i ponovljivo uzorkovanje idealno je za kontinuirano praćenje i rano otkrivanje recidiva.
Sveobuhvatno medicinsko izvješće
Pripremio CeGaT-ov interdisciplinarni tim stručnjaka. Sadrži popis svih prihvatljivih lijekova, s odobrenjem EMA-e i/ili FDA-e, za koje se odgovarajući biomarkeri mogu detektirati u tumoru.
CancerDetect® kontinuirano praćenje
Za serijsko uzorkovanje, izvješća o napretku automatski se generiraju od drugog uzorka nadalje. Dodatna izvješća o uzorcima mogu integrirati bilo koji broj prethodnih analiza tekućih uzoraka biopsije. Zahvaljujući jasnim ilustracijama i tablicama, izvješće o napretku omogućuje da se promjene u pojavi praćenih tumorskih mutacija identificiraju na prvi pogled. Indikacije recidiva tako se mogu otkriti u ranoj fazi, pacijenti sa stabilnom bolešću mogu se redovito pratiti, a pojava rezistentnih mutacija tijekom liječenja može se odmah razmotriti u planu liječenja.
Detekcija recidiva
Nakon operacije/liječenja, pacijent se smatrao da je bez tumora. Redovita testiranja tekuće biopsije otkrila su progresiju tumora, pokazujući da povećanje varijante specifične za tumor prati recidiv tumora. Vrlo osjetljiva detekcija ovog biomarkera može otkriti recidiv tumora ranije nego konvencionalne tehnike snimanja. CancerDetect stoga može pomoći liječnicima u praćenju minimalne rezidualne bolesti i otkrivanju recidiva u ranoj fazi. Preporučuje se redovito testiranje.
A = vrijeme klinički detektabilnog recidiva ili relapsa
B = vrijeme klinički detektabilnog recidiva ili relapsa i stečene rezistencije
Nadgledanje tijekom liječenja:
detekcija otpornosti na
liječenje
Nakon liječenja, pacijent je podvrgnut snažnoj regresiji koja rezultira stabilnom bolešću. Kontinuirano praćenje pruža ažuran molekularni profil tumora i na vrijeme otkriva pojavu otpornosti na liječenje. Ovdje se pojavljuju dva dodatna subklona osim mutacije primarnog tumora, zbog čega se liječenje mora odgovarajuće prilagoditi. CancerDetect omogućuje rano otkrivanje poznatih mutacija povezanih s rezistencijom i pomaže u prilagodbi režima liječenja prije izrastanja rezistentnog tumora. Preporučuje se serijsko testiranje (optimalno prije liječenja i redovito tijekom liječenja).
CancerDetect® uzorkovanje
3x cfDNA epruvete od 10 ml za tekuću biopsiju. Uzorci se šalju na sobnoj temperaturi. Uzorci trebaju doći u laboratorij unutar 7 dana. Ako se cerebrospinalna tekućina ili tekućina iz cista koristi kao početni materijal, molimo smanjite uzetu količinu ako je potrebno.
BRZO IZDAVANJE NALAZA
2-3 tjedna nakon što uzorci stignu u laboratorij
SIGURNOST
Najviši standardi povjerljivosti i kvalitete
POUZDANOST
RAZUMLJIVOST
CancerDetect® prikaz slučaja
Pacijent i indikacija:
- 42 godine, žena, metastatski karcinom pluća nemalih stanica (NSCLC) s mutacijom EGFR L858R u primarijusu
- recidiv nakon početnog odgovora na liječenje afatinibom
- rekurentni tumor neoperabilan, nije moguća biopsija tumora
Primarni nalaz:
Rezultat analize bezstanične DNA korištenjem standardnog panela za rak pluća ostao je negativan.
CancerDetect® nalaz:
CancerDetect® analiza otkrila je 2% sadržaja tumora u tekućoj biopsiji i otkrila poznatu mutaciju EGFR L858R, kao i dodatnu mutaciju otpornosti na EGFR T790M. Mutacija EGFR T790M predstavlja jedan od najčešćih mehanizama rezistencije na inhibitore tirozin kinaze (TKI) i tipično se javlja u bolesnika s NSCLC nakon prve linije liječenja TKI. Kod ovog bolesnika liječenje je prilagođeno inhibitorom EGFR treće generacije osimertinibom.
Ako želite saznati više o CancerDetect ili
O kompaniji CeGaT…